Das Wartenburger Gebiet stand seit 1254 unter der Landeshoheit des ermländischen Fürstenbischofs, das Amt Allenstein und Umgebung seit 1288 unter der Hoheit des Frauenburger Domkapitels. Beide Ämter gerieten im Zuge der verlorenen Schlacht von Tannenburg im Jahre 1410 am 14. Oktober 1466 unter polnische Lehnshoheit, ohne ihre bisherigen souveränen Landesherren, dem Fürstenbischof oder dem Domkapitel des Ermlands, entfremdet zu sein.

Mit der polnischen Teilung im Jahre 1772, durch die das Ermland an den Staat Preußen viel, bildeten die Ämter Allenstein und Wartenburg einen Teil des neuen Kreises Heilsberg, der zum regierungsbezirk Königsberg kam. Im Jahre 1871 wurden die beiden Ämter und Dekanate Allenstein und Wartenburg von dem Kreis Heilsberg losgelöst, und es entstand aus ihnen der Kreis Allenstein mit Sitz in Allenstein und einen Landrat an der Spitze.

Die Stadtgemeinde Allenstein schied auf Grund des Vertrages vom 17.Februar 1910 am 1.April 1910 aus dem Kreis Allenstein und wurde kreisfreie Stadt. Danach nannten sich der bisherige Kreis Allenstein Landkreis Allenstein und die Stadt Stadtkreis Allenstein. Der Sitz des neuen Landkreises blieb weiterhin in Allenstein. An seiner Spitze stand nach wie vor der Landrat, während die selbständige Stadt Allenstein fortan von einem Oberbürgermeister verwaltet wurde. Der Landrat führte seine Amtsgeschäfte vom Kreishaus an der Alle aus. Der Oberbürgermeister verlegte im Jahre 1915 seinen Amtssitz vom historischen Rathaus in der Altstadt in das neu errichtete imposante Rathaus im Herzen der größer gewordenen Stadt. Stadt- und Landkreis Allenstein gehörten zuletzt zu den im Jahre 1905 aus Teilen der Regierungsbezirke Königsberg und Gumbinnen neu entstandenen Regierungsbezirk Allenstein mit Sitz in Allenstein.
Die Gebäude des alten und des neuen Rathauses und das Regierungspräsidium haben beide Weltkriege überstanden.